A differenza dei giochi precedenti della serie, che di solito seguono fedelmente la storia di Dragon Ball, Xenoverse sarà caratterizzato da un'intera nuova storia con i nuovi personaggi presi da Dragon Ball Online. In questo gioco infatti si potranno ripercorrere le battaglie storiche che hanno caratterizzato la serie stravolgendole con l'intervento di questi personaggi inediti.
La storia inizia nella TokiToki City, dove Trunks (Time Patrol) evoca il Drago Shenron per chiedergli di evocare un personaggio innato. Ora ci ritroveremo nel creare il nostro Avatar, e quando abbiamo finito tutte le modifiche, Trunks, il leader della Time Patrol ci recluterà per aiutarlo. Una volta reclutato, il giocatore, quindi dovrà rivivere ogni momento della storia di Dragon Ball, poiche qualcosa di inaspettato sta alterando l'ordine e, di conseguenza, gli antagonisti diventano più forti. Il flusso temporale dello spazio-tempo e la storia originale di Dragon Ball sta completamente cambiando, e anche le Sfere del Drago saranno in serio pericolo, e sarà l'Avatar a riportare tutto alla normalità.
Inoltre sarà possibile ripercorrere la storia con i propri Avatar creati, una volta terminata la stessa modalità con i personaggi classici della serie.